新能源汽车空调系统与传统燃油车在空调压缩机的驱动方式和暖风产生方式上有显著区别。新能源汽车通常采用高压电动空调压缩机，其驱动方式与燃油车不同，由动力电池提供动力，比如宝马530Le插电式混动车型就使用了电动制冷压缩机。
电动空调压缩机通过高压电驱动，驱动电压范围在288V至400V之间，超出此范围会导致功率下降或断开。这种高压驱动方式在燃油车中并不存在，燃油车的空调压缩机是由发动机通过传动带驱动的。
在暖风产生方式上，新能源汽车通常采用电加热方式，有两种具体形式。第一种是通过加热冷却液，再通过循环为暖水箱提供热量，另一种是直接加热经过蒸发箱的空气。例如，纯电动汽车没有发动机作为热源，需要靠PTC加热器来供暖。
PTC加热器采用PTCR热敏陶瓷元件，具有热阻小、换热效率高的特点。而传统燃油车则是通过冷却液将发动机的热量搬运到车内的加热器芯，对车内空气进行加热。
新能源汽车空调系统还包含一些特殊情况，例如宝马530Le插电式混动车型的暖风热交换器集成在发动机和电机的冷却液循环中，由于混合动力车辆的特殊性，行驶时发动机无法将冷却液循环加热至必需温度，因此还配备了电加热器。
此外，电动汽车的制冷空气调节方式有热电式制冷、电动压缩机制冷和余热制冷。纯电汽车采用传统空调系统时，制冷原理与燃油车相同，但制热方式大不相同。
制冷方面，新能源汽车空调系统和传统燃油车都使用了压缩机、冷凝器、膨胀阀、蒸发器等四大部件，分工合作实现循环。制热方面，燃油车主要依靠发动机热量，而纯电汽车则通常依赖PTC电加热。热泵空调系统结构更为复杂，能够自由切换制冷和制热循环，减少对PTC电加热的依赖。
在空调系统组成构造上，新能源汽车空调系统增加了PTC加热系统和电动压缩机。制冷系统由冷凝器、电动压缩机、蒸发器、电子膨胀阀、热交换器等构成，供暖系统则包括电子水泵、水加热器(PTC)、暖风四通阀、暖风芯体。
在能效比方面，电车空调系统的能效比普遍更高，可达3.0左右，而传统燃油车的能效比则多在2左右。但在高速行驶时，燃油车空调冷凝器的散热效率提高，能效比也会提升至3.0左右。
